Игроком выступал за СКА Ростов-на-Дону, «Даугаву» Рига.
В начале 1980-х окончил Высшую школу тренеров, стал работать тренером в ростовском СКА. По линии спортивного комитета дружественных армий получил предложение из Мозамбика. Несмотря на то, что в стране шла война, согласился работать там и уже на второй год работы выиграл чемпионат. В 1985—1988 — главный тренер мозамбикского «Мачедже» (Мапуту), в 1988—1991 — главный тренер и начальник команды СКА (Ростов-на-Дону).
С 1991 работал в Африке. Был главным тренером мозамбикских клубов «Мачедже», «Кошта ду Сол», сборной Мозамбика, клубов из ЮАР «Орландо Пайретс», «Морока Своллоуз», «Буш Бакс», «Мамелоди Сандаунз». В 2004 году работал тренером и главным тренером московского «Динамо», в конце 2005 — три месяца главным тренером в египетской «Исмаилии», в 2006 — главным тренером СКА.
Работа Бондаренко в московском «Динамо» запомнилась тем, что он проводил тренировки, используя мегафон.
В ноябре 2008 — июле 2009 возглавлял клуб «Примейру де Агошту» (Ангола), в декабре 2009 стал главным тренером в клубе «Кабушкорп» (Ангола, Луанда). Летом 2010 сотрудничество между сторонами было прервано из-за разногласий организационного порядка, но в январе 2011 Бондаренко вновь подписал контракт с клубом.
Достижения
Командные
Мачедже
Чемпион Мозамбика: 1987[10]
Серебряный призёр Чемпионата Мозамбика: 1986
Кошта ду Сол
Чемпион Мозамбика (3): 1992, 1993, 1994
Обладатель Кубка Мозамбика (3): 1992, 1993,1995
Орландо Пайретс
Обладатель Кубка Южной Африки: 1996
Обладатель Кубка Восьми: 1996
Обладатель Суперкубка Южной Африки: 1996
Победитель Лиги Чемпионов Африки: 1995
Серебряный призёр Национальной Лиги Южной Африки: 1995
Бронзовый призёр Премьер-Лиги Южной Африки: 1996/1997
Мамелоди Сандаунз
Финалист Лиги Чемпионов Африки: 2001
Кабушкорп
Серебряный призёр Чемпионата Анголы: 2011
Личные
Тренер года в Мозамбике (2): 1988, 1995
Тренер года в Южной Африке: 1996
Медаль "За боевые заслуги" (Мозамбик): 1996