В международных стартах под эгидой FIS Марк-Антуан Ганьон дебютировал в 2005 году. Долгое время выступал на местных стартах, а также в рамках континентального североамериканского кубка.
В Кубке мира дебютировал в январе 2011 года на домашнем этапе в Монт Габриэле, где занял девятое место в параллельном могуле. В конце того же сезона впервые попал на кубковый подиум, став третьим в параллельном могуле во французском Межеве.