Родился 10 марта 1857 году во Фридланде (ныне Корфантув, Польша) — Верхняя Силезия. Умер 20 сентября 1937 года в Бад-Гаштайне.
Изначально Федор Краузе изучал музыку в Берлинской консерватории, однако потом переключился на медицину, поступив в Берлинский университет имени Гумбольдта. В 1883 он становится ассистентом Рихарда фон Фолькмана (1830—1889) в хирургическом отделении университетского госпиталя Галле. Впоследствии он работал патологом в Франкфуртском университете (1890—1892), хирургом в госпитале Гамбурга (1892—1900), а затем руководителем хирургического отделения госпиталя Аугуста в Берлине. В 1901 году он становится профессором (associated professor) Берлинского университета. В Берлине тесно сотрудничал с известным немецким неврологом Оппенгеймом (1858—1919).