Николай Волобуев пришел в органы госбезопасности в 1976 году. Окончил Академию ФСБ России, прошел в контрразведке все должностные ступени - от оперуполномоченного до начальника Управления контрразведывательных операций Департамента контрразведки ФСБ. Женат, двое дочерей.
Именно Волобуев курировал от ФСБ информационное освещение дела Игоря Сутягина - он предоставил прессе данные о компании Alternative Futures. Ранее он отчитывался по делам Платона Обухова, Валентина Моисеева и другим громким шпионским процессам. Кроме того, он докладываето годовых показателях ловли шпионов. Например, в мае 2002 года он сообщил, что за 2002 год Управление контрразведки ФСБ выявило более 80 кадровых сотрудников спецслужб иностранных государств, работающих в России. По словам генерала, в 2001 году были обезврежены 45 агентов зарубежных спецслужб, в том числе двоих российских граждан.
Кроме того, сотрудники ФСБ нашли агентов западных спецслужб и среди журналистов. По данным Волобуева, 31 иностранный корреспондент из числа аккредитованным в россии так или иначе занимался "незаконной журналистской деятельностью". 18 из них был закрыт въезд на территорию России сроком на пять лет, а действующие визы были аннулированы. Начальник УКРО тогда заявил, что ФСБ обеспокоена "новыми методами вербовки", применяемыми западными спецслужбами. В качестве оплаты за оказываемые информационные услуги западные спецслужбы предлагают "иностранную валюту, различные ценности, содействие в устройстве родственников вербуемых на работу в совместные предприятия, оплату обучения за рубежом детей кандидатов на вербовку, а также различные премии или субсидии от имени зарубежных общественно-политических фондов".
В 1995 году Волобуев был делегирован ФСБ в состав межведомственной комиссии по международному партнерству в области образования. В ноябре 1999 года еще будучи заместителем начальника УКРО, Волобуев вошел в состав оргкомитета по подготовке и проведению чемпионата мира по хоккею с шайбой 2000 года - наряду вместе с тогдашним премьером Владимиром Путиным.
В июне 2002 года был назначен первым заместителем руководителя Департамента контрразведки. Входит в состав Межведомственной комиссии по упорядочению въезда и пребывания на территории Российской Федерации, комиссии по миграционной политики, Межведомственной комиссии по вопросам использования федеральной собственности в сфере туризма и гостиничного хозяйства.
4 июня 2004 года Михаил Фрадков назначил Волобуева заместителем председателя Государственного таможенного комитета РФ.